بالرغم من أن هناك العديد من الأقاويل التي تؤكد أن تناول الفلفل الحار لها فوائد كثير وتزيد من مناعة الجسم وتطهر الأمعاء إلي إن هناك العديد من الدراسات الحديثة حذرت منه.
ومن أهم الأضرار التي يسببها تناول الفلفل الحار وحذر منها الأطباء:
1- الإسهال.
2- الطفح الجلدي.
3- تهيج المرئ بسبب حرارة الفلفل ويمكن أن يسبب صعوبة في التنفس.
4- الغثيان والقئ .
5- احمرار الجلد وتورمه .
6- البواسير خاصة لدي الرجال.